当上了御前太尉的风凌真，更是尽心尽力的为蒙元朝廷卖命，愈加变本加厉的迫害汉人。
很快就到了元朝末年，天下大乱，各地义军纷纷并起，反抗蒙元朝廷。
为了镇压各地义军，蒙元朝廷除了派遣主力部队之外，也下令降教协助“剿匪”。
而范黎也率领降教弟子，积极配合蒙元朝廷，四处征伐各地匪患。
由于降教的弟子众多，且有降术傍身，因而在剿匪的过程之中，灭掉了不少义军，立下了不少的功劳。
直到奉命围剿郭子兴的红巾军，范黎所率领的降教，终于踢到了铁板。
当时与范黎对阵的，正是日后大名鼎鼎的大明军师刘伯温。
双方展开了激烈的斗法…
最后还是刘伯温旗高一着，在斗法之中击败了范黎，并将他重创，并乘胜追击，将他麾下的降教弟子，灭杀了大半。
在逃亡的过程中，范黎伤重身亡。
自此一役，降教损失惨重，几乎一蹶不振。
随后，风凌真当上了降教的新任掌教，继续跟随蒙元朝廷，与义军作战。
但是后来朱元璋崛起，不但击败了陈友谅，还击败了蒙元朝廷的主力。
直到朱元璋率领明军进逼元大都时，蒙元朝廷竟然派出降教，前去迎战明军主力部队，其实就是想让他们当炮灰，为逃跑争取时间。
无奈之下，风凌真只好硬着头皮，率领残余的降教弟子，去迎击明军主力。
实力已经大不如前的降教，很快就被明军击败。
被击溃之后，风凌真逃离，跟随蒙元朝廷的残兵败将撤离元大都。
撤离之后，风凌真竟趁乱收拢了不少人，并通过各种威逼利诱的方式，怂恿他们加入降教。
于是降教就这样迎来了“第二春”，甚至一度膨胀到十万之众，而风凌真更是被蒙元朝廷奉为成了新的“国师”。
但是蒙元朝廷的势力已经日薄西山。
没多久，大明王朝建立，朱元璋更是将蒙元朝廷的残余势力赶入了漠北。
明朝建立之后，开始进行大清算，其中就包括降教。
因为降教曾经是明军的大敌，而且许多明军将士死于降术，因此降教被朱元璋列为邪教，下令必须诛灭降教！
当时负责剿灭降教的将领，正是朱元璋的第四子，燕王朱棣。
为了消灭恶名昭彰的降教，朱棣命令麾下最厉害的谋士姚广孝出马。
当时的姚广孝，已有“黑袍妖僧“的称号，不但擅长神机妙算，而且一身玄门秘术也强到了让世人仰望的地步，丝毫不比刘伯温差。
奉命对付降教的姚广孝，很快就找到了降教的总坛的所在位置，并率领大军一路杀了进去。
于是降教迎来了灭顶之灾，降教弟子纷纷被诛杀，曾经的十万弟子，也抵挡不住明军的攻势，没多久便被剿灭了大半人马。
就连风凌真，也在与姚广孝的斗法之中残败，却得以侥幸逃脱。
逃过一同劫的风凌真，见到蒙元朝廷大势已去，又担心自己身上有太多的“黑历史”被明军清算，便率领十几名忠实弟子趁乱逃离，化为道门中人，混入江湖之中…
隐忍了十数年，直到朱元璋驾崩，将皇位传给了孙子朱允炆，也就是建文帝，引发了燕王朱棣的强烈不满。
后面建文帝还实施了削藩的政策，终于彻底惹怒了燕王朱棣。