空袭过后，上海市的发电能力从25万千瓦下降到4千千瓦，由此造成上海市区工厂几乎全部停工停产，大多数街区电力供应中断，高层建筑电梯断电悬空，许多商店关门停业，大上海“十里洋场”陷入一片黑暗，灯火管制使得每户家庭只能每天点一盏电灯半小时。
另由于上海的自来水生产单位也遭到空袭破坏，使上海自来水供应出现困难，市民的马桶、厕所都无水冲洗。此次空袭共造成了1148人伤亡和1180间房屋损坏。
空袭之后，上海市人民**紧急制定了多项措施，以力保重要的战略物资和市民人员的安全，并组织力量修复遭到破坏的电力设施，经过42小时05分钟的抢修，上海市基本恢复正常供电，然而上海的工业生产和市民的正常生活仍然受到了较大影响，造成经济损失达500万美元。
由于当时蒋匪军轰炸机的性能要躲避地面炮火的攻击必须采取高空目测投弹，此种投弹方法的命中率相当低，而蒋匪军对上海的轰炸却有较高的命中率，因而中共保密部门判断必有地面引航人员为飞机提供电台导航，因而将赵继统小组紧急调来协助破案。
另外，**请求苏联给予空中力量支援，苏联同意援助，并于1950年3月在巴基斯基等将领率领下，派出108架各类战机组成的混合集团军进驻上海，帮助中国大陆加强空中防御，其中还包括有38架当时世界最先进的亚音速战机--米格-15战斗机。
随后在当年3月至5月的4次空战中苏联战机击落了6架国军战机，迫使蒋匪帮方面停止了对上海的进一步攻击。之后，蒋匪空军无力再对上海进行成规模的空袭或骚扰，上海空域较大规模的争夺战结束。
“二六”大轰炸发生后，上海市市长陈毅立即召开了紧急会议。陈毅愤怒地一拳砸在桌子上斩钉截铁地说：“我们一定要粉碎敌人的破坏阴谋！”上海市公安局领导人也在陈毅市长面前立下了军令状：尽快侦破敌特秘密电台，粉碎敌人的下一次轰炸阴谋。
如果没有潜伏特务的通风报信，国民党飞机也就失去了轰炸的目标，所以当务之急是打掉台湾当局的耳目。上海解放以来，在上海市公安局的日夜奋战中，公安人员很快破获了解放前潜伏在上海市的特务电台几十起，给了国民党沉重的打击。
但是，还是有几部极为隐蔽的特务电台未能查获。据被俘人员交代，上海市内还隐藏着一个叫“吴思源”的特务，他可能是一个与“二六”大轰炸有关系的主要内鬼。
赵继统依然决定从资金入手，根据以往敌电显示：49年11月份台湾保密局发给吴思源775万元人民币（旧币）的情报，侦察得知，这笔经费是以汪洋名义由金城银行汇沪林森中路（现淮海中路）施家瑞收。
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