按照黄明远的计策，杨广一方面对江南世家示之以恩，这一次更是选拔了数百江南世家的子弟为官；另一方面则用军队震慑，驻军深入各州，双重其下，迅速使得地方上开始安定下来。
若是按照既定政策实行，数年之后，江南地区还真可能成了杨广稳固的大后方。
杨广和黄明远重视江南世家，但其他朝臣并不这么认为。
泗州刺杀天子事件之后，杨广命令大臣彻查此案，并下旨江南各地追剿万安堂余孽，捉拿刺驾之贼子。又命各地取缔天师教，缉拿妖人。
这件事本来是对南陈余孽一次有计划的清洗，其目标性也很明确，就是反对势力。在杨广看来，此事并不会对江南的局势有太大影响。
这朝野内外，最忌讳谋反之事，一有风吹草动，朝廷往往捕风捉影，见风是雨。
而且这皇权社会，尤其是在皇帝下达对案件的指示后，司法官员往往极力迎合君上心理，将嫌疑人犯屈打成招，把鸡毛蒜皮之事办成大案要案，然后大肆株连，揪出一撮又一撮的谋逆案犯。
因此负责查办此案的大理寺少卿上仪同三司于士澄在江南大肆追查刺客，其本着“宁可错抓千人，不可使一人漏网”的态度，只要稍有嫌疑，就抓起来严刑拷打。重刑之下，抓捕的人越来越多，竟然有数百人人被迫承认自己是刺客，而涉及到的万安堂余孽达数万人之多，俘囚满狱。
本来一场有限度的追剿活动，最后竟有漫延之势，成了一场对江南势力的大清洗。
刚开始第一茬案犯报到杨广这里，杨广还并不以为意，大手一挥，“并令同日斩决”，下令将这数百人同日处死。
但之后案犯越来越多，连杨广看了都满是错愕。
虽然诛恶务尽，但若是这样杀下去，怕是整个江南的官吏、士绅都要杀光了。还怎么拉拢江南世家。
杨广命大理寺和刑部要严格复核这些案件。大理丞张元济觉得此事颇为奇怪，这些被指控为万安堂余孽的案犯涉及到方方面面，若是真的全是万安堂余孽，对方早就能一举掌控江南了，何必继续蛰伏待机。
张元济调阅了相关的文书档案，发现大多数人的罪状都是似是而非。
但于士澄在大理寺本就威望很高，且此次是天子下令的查案，本着杀错不能放过的想法，龙威之下，司法部门竟没有一个人敢触逆鳞，这事便成了定案。
于士澄在江南大肆株连，每日被杀者无数。被抓获的叛逆越来越多，最后竟然达到满衙皆贼的地步。到了这种局面，于士澄也是大吃一惊，不过他骑虎难下，容不得后退，只得硬着头皮将这个案子查下去，坐实了众人的附逆之罪。
终于，江南的士庶终于无法忍受了。
十月四日，万安堂余孽谢异、王褒、顾子元等人在吴州昆山（治所在今上海市青浦区东南）杀死县令，扯旗造反。