同样对于基因的研究也更进一步了，这比起原作来说要快了不少，当然大蛇丸也没放弃研究怎么解封双手，也被他发现了一些蛛丝马迹，想要解封双手其实很简单，只要找到对应的面具，召唤出死神，划开死神的肚子就可以了，但是现在的大蛇丸可不知道这一点。
由于君麻吕被罗根给提前弄走了，所以音忍五人众的领头人物从君麻吕变成了其他人，是个罗根从未听说过的人，实力也是非常不错，应该是大蛇丸给自己预备的素材。
大蛇丸也没想到这一次佐助竟然会选择离开木叶，他的计划是潜移默化的影响佐助，谁知佐助跳过了整个过程，直接选择投入大蛇丸麾下了。
这让大蛇丸喜出望外，他的计划可以加快脚步了，所以对于佐助也做出了一系列的安排，增强佐助的实力，成了大蛇丸的主要任务。
而鸣人经过这一次的变故，开始发生了改变，作为从小孤身一人的鸣人，他理解不了佐助的痛苦，作为对手挚友的他们从小一起长大，经历了很多，鸣人将佐助当成了自己最好的兄弟，所以除了佐助的父母之外，最难过的就是鸣人了。
对于佐助的叛逃，宇智波富裕和宇智波美琴并不意外，因为罗根早就和他们说过了，而且也和他们保证过佐助虽然会经受一些波折，但是不会有任何的危险，可作为母亲的美琴来说，还是接受不了两个儿子的选择。
终日以泪洗面的美琴不愿意面对现实，最终恳求罗根将她封印，等两个儿子都回来之后，再将她解封，罗根答应了她，利用时间能力将美琴封印了。
富岳没有阻止，他明白自己妻子的痛苦，不过富岳没有选择被封印，因为他要看着自己的两个儿子到底会成长到何种地步，他不愿意错过。
而在这个时候，罗根突然想到一件事情，在博人传中，大筒木浦式会在差不多这个时候穿越时间来到木叶抓捕鸣人，但是因为罗根的意外出现，未来发生了很大的改变，罗根也不敢确定大筒木浦式会不会出现了。
同时罗根也不希望大筒木浦式现在出现，因为即便是浦式现在出现了，罗根还真没有能力去夺取大筒木浦式的眼睛，轮回眼的进化还没有结束，罗根的实力根本无法发挥，浦式出现的话，罗根最多只能杀了浦式，剥夺的能力此刻根本无法动用。
罗根只能祈祷浦式最好是在他眼睛进化完毕之后再来，那样罗根的计划就完全实现了，为了防止浦式的出现，罗根安排了多个木遁分身监测时空，但凡有一点异常，罗根都能够及时发现。
但是到鸣人和自来也离开木叶，大筒木浦式以及未来的佐助和博人都没有出现，罗根在松了一口气的时候，也有些失望。
罗根筹谋着虽然不能夺取浦式的眼睛，但是可以在杀了他之后将他封印，等剥夺的能力可以使用之后再进行剥夺，虽然这样会导致能量流失，眼睛进化不完全，但是只要有桃氏和金氏在，流逝的能量到时候都可以补回来，更重要的是让罗根有了很多的底气和实力面对未来的壳组织。