其实，历史到这里已经发生了巨大的变化，说翻天覆地那太过了，但是说巨大还是恰当的。李存真这只蝴蝶已经彻底打乱了明清交际中本来的历史轨迹。
马逢知没有被满清问死，反而投靠南明，改回本名马进宝，如今在新东江镇大展拳脚；康熙平台时重用的姚启圣此时被李存真收服，正为南明拼命搞钱，其实李存真还打算用姚启圣这样具有侠肝义胆的人来对付旧官僚和将来不肯配合他改革的缙绅；平定三藩之乱中起决定作用的周培公、赵国祚如今一个被南明软禁，一个为南明不懈奋斗，甚至参加了坐天山大战。响应三藩之乱的王辅臣如今却在南明南京玄武湖挑大粪。康熙时代的著名清官于成龙如今却在南京坐牢。
难能可贵的是，李存真胸怀宽广，量大能容，懂得千金买骨的道理。
大明忠臣黄得功的部将，伙同田雄出卖弘光皇帝朱由崧，降清后于顺治三年擒杀南明瑞昌王朱谊泐，数次击败郑成功，本来应该在康熙二年战死厦门的满清一等襄武侯，确立满清闽安军事重镇地位的福建提督，清初名将，《贰臣传》名列一等名录的马得功也被吸收到李存真的阵营当中。
不是没有人提出过反对意见，甚至夏景梅、折光秋等人都认为马得功罪大恶极而且人品有问题。马得功被关盛年俘虏之后自问必死无疑。但是，李存真却说，马得功之所以投降是对南明内讧和朝廷腐败失去了信心，当时如果有更好的选择马得功也不至于投降满清。如今只要他能够为大明鞠躬尽瘁，何人不可用呢？
这句话传到马得功耳朵里，感动得他痛哭流涕，跪在孝陵前发誓此后绝不背叛大明。
然而，即便如此，常琨却对李存真说要“防人之心不可无”，就算马得功是亲儿子也要当心，不要忘了当年白芷兰的教训，任何人都可能会反叛，只要价码合适。
于是，李存真提拔马得功的儿子马三奇为吴王府侍从官，和保罗的儿子黑尔一起为“大明”服务。
李存真的到来不仅改变了这些人的命运，甚至对洋人的命运也有影响。本该因为散布所谓的“异端邪说”，不被罗马教廷所容而被烧死在马尼拉的法国神学家皮埃尔·勒内·加布里埃尔如今成了南明的舰艇专家，官员。受到南明的保护，皮埃尔被烧死的可能性大大降低了；
本该在第二次英荷战争中被当成间谍而被荷兰东印度公司绞死于马六甲的英国火炮专家保罗·克拉克·麦克维斯如今也成了李存真的座上宾。
李存真这只蝴蝶如今俨然已经变成了一只大鹏鸟，改变了历史的进程。在历史上该死的没死，不该死的却死了。
本该死在顺治十八年正月的顺治皇帝推迟了几个月在感恩寺被南明摘了脑袋，使满清权威受到巨大打击；围剿夔东农民军的鳌拜之弟穆里玛，平定三藩之乱中立下赫赫战功的贝子章泰和一大批满洲将校全都死在了坐天山；在康熙二十八年与准格尔部作战当中立下大功的苏拜的儿子和讬也在坐天山大战的“万骑冲锋”中被南明链弹打死。
现在，李存真眼前的这个跪在地上磕头不止的耿精忠可能也是诸多被改变命运的人之一。三藩之乱时耿精忠叛乱，后来被康熙逼降用作镇压其他藩王的马前卒。三藩平定后，耿精忠被卸磨杀驴，遭凌迟而死。可谓生的憋屈，死的凄惨。
看着耿精忠，李存真自忖：就算你以后想叛乱怕是也不会在福建了，福建已经是我大明的地盘了。你说你这家伙……你以后怎么办啊你……啧啧……死活荣辱都要看你自己的决定了。
“还是快起来吧！”说着，李存真搀扶起了耿精忠。
耿精忠站了起来，用袖子擦了擦眼泪，竟然还忍不住抽泣。
李存真叹了一口气说道：“精忠贤侄，我知道你这是代你父你祖求情，其实这大可不必。”
耿精忠生于列皇殉国那一年，也就是崇祯十七年，到如今不过十七年而已。但是按照古人对年龄的计算，耿精忠由于生在农历四月二十二日，八月初一之前，因此该算做十八岁，而不是十七岁，也不是十九岁。
李存真这一世算起来应该是生于崇祯元年左右，比耿精忠大了足足十七岁，比耿精忠的老子耿继茂小两岁，叫耿精忠为“侄”，一点也不过分。
“他们的错误都是他们的，跟你一点关系也没有。至于南京之战，你也是因为你父这才充分陷阵。那时候你才十七岁，敢于乱军之中冲锋，真的是少年英雄。至于战败被俘，也不是你的错。”
“不敢……不敢……冒犯殿下兵威，还请殿下恕罪！”
李存真继续说道：“贤侄啊，这些日子你过得还好吧？”
李存真这是明知故问。耿精忠虽然被俘，但是没有被安排去挖矿、淘沙，更没有被安排去挑粪。他一直被单独软禁在南京城里，好酒好肉的伺候着，偶尔还能听曲，日子过得好着呢。就是午夜梦回，孤独寂寞，空虚无聊，又为自己的前途性命担忧这才显得有些精力憔悴。
“殿下对臣很好，罪臣，罪臣很知足，时时刻刻不敢忘记殿下的大恩大德。”耿精忠说道。
李存真听了大笑说道：“这就有点说得过头了。”
耿精忠赶忙说道：“殿下执掌生杀大权，没有杀臣，已经是莫大的恩情了，臣没有说得过头。”
李存真听了不自觉地点了点头，继续说道：“本来你被俘的时候我就给你父亲去了书信，让他用银子来赎你。我要的也不多，不过二十万两而已。但是，你父可能觉得我成不了大事，或者觉得很容易就能救出你来，一直也没有消息。
后来我放走了你的亲信张朝忠，让他带书信给你父，结果也没有消息。