朱由校想直接去长沙船厂当设计师的愿望当然被朱由栋拒绝了：小孩子家家，字都念不全，各种测距、函数计算都不懂，当个毛的设计师。所以朱由栋还是让他明年开春去方山学校报到。
时间来到1613年，完成了开年的各种礼仪性质的活动后，朱由栋带着自己的弟弟妹妹们进入了方山学校。
皇家子弟在平民学校念书，理所当然的激起了刚刚上任不久的新御史言官们的集体劝谏。但是在万历根本不理，朱由栋直接把这些奏章扔给自己门房的残军生火御寒的情况下，御史们也是毫无办法——皇族不是大臣，被弹劾了是不用在家写自辩的。
朱由校们的身份想要保密，那几乎是不可能的，所以朱由栋也干脆不保密了。不过呢，他还是希望自己的弟弟妹妹们不要太特殊，除了田尔耕派出了一队锦衣卫暗中保护外，这些小孩子就没有其他特殊待遇了。
至于你说朱由校们进了方山会不会借此培养自己的班底？哈！一二年级的小孩子可能知道这是皇家子弟后会有点讨好的想法，但随着年龄的增长，只怕个个都要避之不及：方山的教育是超越这个时代的，这个学校的学生也个个志向高远——给藩王做臣属，天天陪着藩王在那个高级监狱里玩泥巴？大家还是摇头快一点。
至于像朱徽娟这样的女孩子，那更是会让方山的男生们像躲避瘟神一样躲开，生怕被看上。理由同上：明代的驸马极惨！当不了实权官员不说，连什么时候和自己的媳妇睡觉还得打报告！
总之，慈庆宫的孩子们最终都顺利入学了，而朱由栋也来到方山实验室，召开新一年的科研联席会议。
“各位先生、师傅新年好啊。”
“殿下新年好。”
“这个，你们这里出产的都是整个大明最新式的东西，孤就不送你们什么小玩意了。咱们来点俗气的，一人一个金饼，来，孤给大家拜年了。”
“哎呀~~殿下，小老儿明天把孙子孙女都带到兴华宫给您拜年！”
“老黄，你忒不要脸了。哈哈哈~”
一阵寒暄热闹后，众人坐定。朱由栋开口道：“老规矩，一个一个来，去年的成绩，今年的研发方向，存在的困难，需要其他学系或者孤的哪些协助。”
是的，借着这次搬家。方山学校和方山实验室真正的融为一体了：各个实验室成了学校的学系，真正的走上了学、研、产三位一体的道路。
“是，那就我们数学系先来吧。”
所谓数学系，其前身是方山的基础科学实验室，代替利玛窦暂时执掌这个学系的，是以前方山学校的精英数学教师李国俊：“殿下，去年因为利奇先生去世，我们取得的成绩不多。大体如下：完成了七年级到九年级数学教材的编写。引入了正负数、代数式、幂的运算、方程式、三角函数等，发现、论证了利玛窦定理（韦达定理），平面几何方面已经推导、证明了一百四十条定理……总之，按殿下教令，今年开始，学校招收七年级学生，我们数学系完全可以承担相关教学任务。
本年度本系除完成学校七个年级的教学任务外，主要研究方向是指数、幂函数、对数、立体几何、解析几何等。存在的困难嘛，当然是利奇先生去世后，很多东西得我们自己慢慢钻研。不过还好，现在数学系正式成立了，学校所有数学老师聚集在一起，群策群力，总是能够慢慢想到办法来解决的。殿下？”
“嗯？哦，极好！极好！”穿越前曾经被高数折磨得生不如死的学渣听着这函数那指数，只觉得全身都起了鸡皮疙瘩，那遥远的恐惧，似乎跨越时空降临到了他的身上。所以李国俊开始讲的时候，朱由栋还可以装模作样，到了后面，他都快被吓瘫了。
“孤，不太擅长数学。但是也知道数学是所有自然科学的基础。因此，虽然数学不太容易看到直接的产出，但孤对数学系的支持，那是肯定不遗余力的。至于说利奇先生的接任者，孤已经去信耶稣会让他们选派了。还是那句话，学术过硬，传教方式温和的，我们就供起来。反之，就让他们滚蛋！”