此后蒙古内乱，布里牙特乌格齐于AD1402年杀元昭宗爱猷识理达腊的儿子尼古埒苏克齐汗孛儿只斤·额勒伯克。而后，布里牙特乌格齐立尼古埒苏克齐汗之子孛儿只斤·坤帖木儿继位。AD1402年，布里牙特乌格齐杀掍特穆尔汗后称汗。AD1408年，蒙古太师阿鲁台杀布里牙特乌格齐，迎立孛儿只斤·本雅失里为汗。至此蒙古正式分裂，北元朝廷覆没，鞑靼、瓦剌崛起。两个能力有限又势均力敌的枭雄阿鲁台和马哈木分别崛起，分别担任鞑靼太师与瓦剌太师，并相互攻讦。（鞑靼、瓦剌。。。这种乱七八糟的蒙古概念还真是不好理解。一般说起来，鞑靼指漠南蒙古本部，瓦剌指卫拉特蒙古。在明际，草原上两个最大的势力，就是鞑靼与瓦剌。鞑靼原意就是蒙古是同一概念，这里特指代黄金家族势力、北元余孽，在北元朝廷覆灭后，混得不咋的；瓦剌则是离黄金家族较远的蒙古分支，包括卫拉特四部，他们原本在中亚，在北元朝廷覆灭后，在蒙古草原上活跃起来，成为明初的主要北方威胁；其实还有所谓兀良哈蒙古，即所谓朵颜三卫，明初就投入明廷帐下了，时附时叛，后来满清崛起，又是蒙八旗的主力。。。这这，就一般不提了；还有所谓漠北蒙古，喀尔喀人，与关内关系不大，也早早与满清建立联系，一般也不提。）说起来，北元式微，瓦剌崛起，还逃不脱永乐大帝的功劳。朱棣自篡位后，心中不安，所以一直想建功立业遮遮羞，有有名的就是他五次出关、武装游行。当时阿鲁台拥立本雅失里，本雅失里年轻气盛、斩杀明使，朱棣立马找到理由出兵，结果热闹过后、一地鸡毛，他都不知道自己要什么！
在与朱棣的混战中局势更加复杂，朱棣之后明朝进入唯一的清明---仁宣之治，稍以消停。草原上的结果是阿鲁台和马哈木谁也没坐大，就分别在内战中挂了。马哈木的儿子脱欢倒把瓦剌做大了，占据了草原的话语权。（黄金家族的势力缩小到可以忽略不计了。）脱欢的儿子绰罗斯也先把蒙古日益掉落的国运复振了一把，不过那也是明朝皇帝朱祁镇脑残地全力配合所致。这就是大名鼎鼎的“土木堡”咯。
朱祁镇现代被揭露的“叫门天子”的嘴脸实在太难看！当然，洗白的人也有，比如大名鼎鼎的当年明月！虽然土木堡的锅可以让王振背，杀于谦是谁的锅？朱祁镇被也先太师抓了以后，也先乘势带领蒙古军挟持着朱祁镇南下，叫门天子桥段上演，一路杀到北京城，瓦剌与也先也到达了他们的巅峰！多亏于谦说学逗唱救了场。。。（大雾划掉。多亏于谦殚精竭力救了北京城，也救了大明。）
所谓盛极而衰，瓦剌的也先太师把手伸到名义上的汗庭，干涉名义上的大汗继承，于是脱脱不花汗与兄弟阿噶多尔济大打出手。也先先扶持阿噶多尔济登上汗位，后来不过瘾，自己也公然上位，肆意残杀黄金家族。（难怪黄金家族后来那么少。）这个是也先有点飘了，作为绰罗斯部的没有黄金家族血统，也先高估了自己。也先几乎遭至了各部落的一致反对。也先自己也被阿剌知院干掉。而出黄金家族的鞑靼人也绝地反击，孛来干掉了瓦剌的阿剌知院，重新恢复了黄金家族的血统，脱脱不花的儿子马可古儿吉思登上这有名无实的汗位。
明景泰六年（AD1455年），在那位打赢了土木堡之战、打输了北京之战的绰罗斯也先太师，死于内斗后，原本强盛的瓦剌帝国就此衰落，瓦剌各部落开始分裂了。(可怜也先也算是那一瞬的芳华，草原又回到了群龙无首。或者这么讲，如果不是朱祁镇送人头，此时期的草原根本就没什么可能掀起高潮！)卫拉特人（瓦剌）之后不得不放弃蒙古高原东部广袤的草场，退居他们的西部故地。原本内部就并不完全团结的卫拉特人，最后也很快分裂成了“卫拉特四部”，即和硕特部、绰罗斯部、土尔扈特部、杜尔伯特部。
其中那出了那位强大的也先太师的绰罗斯部，正是后来准噶尔部的前身。由于之前也先僭越称汗一事，引起了包括卫拉特人在内大量蒙古人不满，因此在早期，准噶尔部丧失了大量的部众，势力衰退，因而整个卫拉特四部的盟主，便由与黄金家族有渊源的和硕图部（和硕特）担任。虽然卫拉特四部之间的关系也是矛盾不断，但是为求自保，在面对自己蒙古本部堂亲（鞑靼，即黄金家族直系后裔察哈尔）的进攻，以及到中亚和叶尔羌汗国（乌兹别克人，出自青帐汗国，也算蒙古别部）打秋风等事情上，都还是保持着极高的团结性。直到明末伴随着准噶尔部（绰罗斯部）的再次壮大，事情又一次发生了变化。（卫拉特四部在强力的也先太师之后，就在鞑靼与漠北喀尔喀部的阿尔坦汗的压力下不断西迁。空出草原的中央舞台让给鞑靼表演。卫拉特四部中，和硕特部占领了青海一带，并对乌斯藏有攻略；绰罗斯部则远走叶尼塞河上游，他们与杜尔伯特部一起，建立了准噶尔汗国，直到明末壮大后回到新疆伊犁河一带；而土尔扈特部走得更远，他们一直西去到了伏尔加河下游，深入俄罗斯，并长期在沙皇底下过活，后来还有所谓“东归英雄传”云云。。。）
伴随着明末准噶尔（绰罗斯部）的再次实力壮大，和硕特部的整个卫拉特盟主的地位便因此受到了直接挑战。当初和硕特部之所以能成为当时卫拉特四部的盟主，是源自和硕特的祖先，成吉思汗的二弟拙赤合撒儿。即具有黄金家族血统的和硕特部，有资格称汗，从而与东面的蒙古各部分庭抗礼。其自身实力并不够强。而在准噶尔部崛起后，自身硬实力不足的和硕特部，在车臣汗时期，只能让准噶尔部的巴图尔珲台吉共为盟主。
不过对于和硕特部来说，更大的问题则是此时和硕特部已经一分为三。其中除了作为本家的车臣汗一支，还有昆都伦乌巴什所率在伊犁河谷的一众，以及由后来的固始汗所率，进入天山南麓的一支。其中前者因为反对准噶尔部与和硕特部共为盟主，最终被准噶尔部胁迫土尔扈特部和车臣汗击败。因此，此时固始汗所率的一支，可以说就成为了和硕特部的希望。
固始汗可以说也是一段传奇，他起先也是受到准噶尔部（绰罗斯部）的压制，因此干脆放弃了天山北麓草场，转而进入南疆和青海北部。由于在之前进入青海的土默特部衰落，因此喀尔喀蒙古一部首领却图汗，在蒙古察合台部首领林丹汗的支持下，占据青海。同时，还有一个重要背景，西藏地区的噶玛王朝统治者藏巴汗笼络和他一样信仰白教的川藏木府土司、却图汗，以及信仰苯教的仁蚌巴土司，一起对抗当时有大量民众基础的黄教。
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