「真是的，到底是怎样啦，连我也被搞乱了！」学园都市夜晚的街上，步履匆匆地行走着一个穿着常盘台中学夏季校服的茶发少女。这位少女便是刚才与御坂妹分离的御坂美琴。此时此刻的她有些心不在焉地回想起与自己的克隆人相处几个小时内发生的事情。
「一起跟猫玩耍，一起吃冰淇淋，互相抢扭蛋徽章……这个样子，就像是真的……」想到这里美琴用力地晃晃头，现在还不是想这些事情的时候，她必须得先解开那个密码，查明这究竟是怎么回事。「总之先要揪出那个制造者！剩下的之后再做！」
而现在，学园都市的某家商场里，戴着军用护目镜的御坂9982号往储物柜上啪啪地敲击着密码。随着喀拉一下储物柜打开，里面露出来的是一个与人差不多高的大提琴箱子。她将大提琴箱子从储物柜里缓缓地拿了出来啪啦一声关上了门。商场里没有任何人发现有什么不对劲的，仿佛这就是一个平常的夜晚。
“谢谢你，春上同学。”栅川中学的某间宿舍里，一位黑发少女有些高兴地望向了自己对面的少女，一边还在与全学园都市学生的敌人——暑假作业战斗，对方摇摇头微微一笑，“没事，我总是受大家照顾嘛。我能够帮上忙做暑假作业很开心呢。”
“一直在忙风纪委员的夏季招募，作业处于大危机状况啊！”初春一边奋笔疾书地抄写着英文单词，突然想起来某个银发少年忍不住嘟着嘴唇抱怨，“明明雨宫前辈就可以写暑假作业不去参加夏季招募……可是固法学姊不让啊……”
“做完了，这样行吗？”春上将手中的作业本递给了初春，对方见此激动得眼泪都快流出来了，“太感谢你了，春上同学！”两人正想再说些什么，突然间，初春放在桌上的手机响了起来打断了两人接下来的谈话。
“喂~？”初春看到手机上的来电显示感到有些惊讶，电话那头是一边跑动一边对着呱太手机说话的美琴，“是初春吗？不好意思这么晚打给你。抱歉我想问你一下，ZXC741ASD852QWE963是什么？”
“咦？这个排，列好像在哪……”初春看着自己在本子上记录的密码若有所思地皱了皱眉头，然后下一秒她就知道了答案，“这个代码，跟安全等级A级以上的情报密码很类似啊。虽然我也曾想要尝试破解……”
“谢谢你，帮大忙了！”但是那边美琴很快挂断了电话，让电话这头的初春叫着御坂学姊之类的话引来了坐在她对面的春上疑惑的眼神，“御坂学姊怎么了吗？”“不知道，怎么了呢？”初春表示自己也不太清楚耸耸肩膀，只是接着与暑假作业奋战。
「A级情报密码……」那边挂断电话的美琴突然想起之前她入侵长点上机学园学生名册的时候那个不知名的黑客就是将安全等级全部提升到了A级来阻止她的入侵。再加上她之前遇到的那个死鱼眼少女也是长点上机学园的……
「难道……这次事件与长点上机学园有关……？」美琴这么皱着眉头，但是这次她的密码破解似乎非常顺利，没有再次遇上上次的那个高级黑客。否则美琴虽然没有太大的把握，但肯定会浪费一些时间。不过……出现在美琴PDA上面的文字是……
而此时学园都市已经完全地暗下来了，在某条空无一人的小巷中，一位面无表情的少女静静地站在那里。少女有着与学园都市第三位超电磁炮一模一样的面容，但少女的脸上却毫无变化，仿佛什么事情都不会引起她的兴趣似的。在她的背后背着一个大提琴盒子。这个就是刚才与美琴告别的御坂9982号。
“真是的，都说了我今天不舒服，怎么还给我安排实验啊~！”突然，一阵抱怨的声音从寂静的小巷中心传来，伴随着缓慢的脚步声，很快有一个白色身影出现在少女眼前。
这是一个有着白色的头发、红色的瞳孔、整齐的五官、有弹性的肌肤、瘦削的身材、缺少肌肉的手脚的身影。也许这样的瘦小的少年放在大街上，如果忽略对方白色的头发以及红色的瞳孔，会变得毫不起眼吧。
一男一女在这种荒无人烟的小巷见面，怎么看都不是什么好事。但是也许是发现自己等待的人已经来了，少女用淡漠的语气缓缓开口，“现在时刻是二十点五十二分，距离第九九八二次实验开始，还剩下七分四十秒。请您移动到指定地点。”
“今天是最后一个了吧？明天我要请假一天。”穿着黑底白纹衬衫的白发少年有些恶狠狠地切了一声。上一次的实验闹得有点大，让他有种不太好的感觉。但是眼前的少女却用着毫无波澜的语气回复，“今天晚上确实是最后一个。但是明天的实验不是御坂能够操控的。”
“啊啊啊，真的是烦死了。”白发少年带着点不耐烦的语气打断了少女的话，他的表情在黑暗中让人摸不清他本人的真实含义，“那么就让今天的实验快点结束吧。”
在不远地墙壁边，靠着一个打开的大提琴盒子。但是大提琴盒子里面的凹陷怎么看都不像是大提琴的形状，反而像是一把枪的形状。是的，这就是现在少女手上拿着的枪。
F2000R突击□□，是一款紧凑型、无托结构、导气式半自动□□。其绰号为玩具兵团，其原因为该型枪为了方便只有14岁生理年龄的女性克隆人操作，主要采用比钢铁质轻的层压塑料所制成，从而看上去像个玩具枪。
小巷中灯管边有几只飞蛾在那里扑闪着，不停撞击着灯管壁渴望光明。而站在小巷中的白发少年一瞬间居然看着那些飞蛾暗自发愣。然后一阵淡漠的语气将少年的目光从飞蛾那边拉了回来，少年抬头一看是站在他对面将护目镜调整好的少女，“二十一时零零分到了。现在开始第九九八二次实验。”