所谓的拼盘式通识教育，是说元培学院的学生可以选修北大校内所有的专业课程，因此元培自己不开设通识教育课，但学生们通过自由组合不同院系的专业课，达到通识教育的结果。在大二时会分专业，同学们可以自由选择北大内任意专业作为主修方向（当然还保留转方向和修习其他专业课程的权利），也可以选择元培的特色专业：例如PPE（政治、经济与哲学），外国语与外国历史，古生物学、整合科学等，顾名思义，这些专业就是将各个院系的相关课程拼盘起来，作为你的必修课。
本世纪启动本科教育教学改革的一面旗帜，元培学院探索厚基础、宽口径的人才培养模式已有13个年头，是国内最早一批试水通识教育的院校。而“元培”在这场人才试验中遭遇的意外、挫败、尴尬甚至争议，都充分折射通识之难和通识之痛。
北大元培是国内通识教育改革中最早的、也是较为成熟的模式，现在通识教育在各个高校铺开，但目前的结果都不是特别好——不过至少迈出了一步。
3、根据元培学院的人才培养方案，新生入学后，理论上可以选全校开设的任何一门课程，想听什么就听什么，课程学习计划全由自己制定；从大二开始，学生可以根据自己的兴趣自由选择学习方向，理论上也不受限制。
“精神上的自由，学术上的自由，学习上的自由。”几乎所有学生在进入元培后，第一感受都是“自由”，但紧接着，多数人就会开始“迷茫”。
一名2004年入学的学生就曾在网上发表过一篇文章，抱怨元培的“自由制度”。比如，理应负责辅导学生选课、选专业的“导师制”发挥作用有限，事实上，元培04级的大一新生连一本院系课程计划都拿不到，必须跑去各院系教务部“蹭着看”。
比起这些琐事，选课的自由就成了更大的障碍—全校的课你都能听，但到底听什么。
在北大，本科课程计划主要分为两块：专业课和通选课。一般而言，专业课难度胜过通选课一筹。按照设想，任何一个元培学生读大二、选定自己的专业方向后，之前选修的其他院系的课程都可替代通选课课程，修满学分即可毕业。
对学生来说，诸如此类的规定无异于“自由待遇”外的枷锁：根据兴趣选课，一旦考试成绩不理想，选专业时就会丧失一定的自由。
不少元培“过来人”，亲历了向“不自由”妥协的过程。北大03级元培法学方向学生张琬婷告诉记者，在元培实施的最初几年，绩点并不是一件被看重的事，“02、03级的学生大多数都是按自己的兴趣选课，选难度大的课在当时是一个趋势。”但此后，绩点导向就越来越重。
“绩点”标准的存在仍令学生们选课放不开手脚。
周文杰，2008年考入元培学院，现任北大13级元培学院班主任。他观察到的情况是，学院里凭兴趣广泛选课的学生越来越少，许多新生一入校计划性就很强。比如，大一第一学期，13级的新生选课集中于经济、管理、数学、政经哲等领域，没有学科跨度特别大的选课。
许崇任解释，元培和各个院系的最大不同在于，传统的专业院系可以不假外力地自我发展，而元培则经常需要学校在背后推一把，不断制定适用于元培的各项特殊政策。“教授需要做研究，需要自己的研究生，那就必定要依托专业院系，光靠元培单方面没有能力办到。”
周文杰坦言，元培学院为学生提供的“自由”，从某种意义上说仍是一种“消极的自由”。“学生们要在完全不明白这专业是怎么回事的情况下，冒着风险去选课程，而且还得判断这些课程能否触及专业核心问题。”尤其对新生们而言，心理压力一下子就上来了。
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