皇帝大获全胜，青海各部看葛尔丹已成丧家之犬，纷纷向皇帝输诚，要和策妄阿喇布坦联合，意图擒获葛尔丹，献于朝廷。
葛尔丹走投无路，只好派出使者到归化城，向临时驻跸在这里的康熙投降。
康熙给葛尔丹七十天的期限，逾期不至的，就要进兵。
而葛尔丹仍旧顽抗到底，始终没有投降的诚意，到了康熙三十六年二月，皇帝再一次亲征。
葛尔丹已经到了掘草为食的境地，想回伊犁，为胞侄不容，想逃往西藏，官军扼守的很严，也成了妄想。
皇帝胜券在握，而葛尔丹宁死不降，到了这一年的闰三月十九，葛尔丹在一个叫阿密阿穆塔台的地方服毒自杀，他的尸体，他的女儿钟齐海，还有三百户人口，已经全数运到。
于是漠北三汗复回故土，而准格尔则归策妄阿喇布坦，皇帝知道他这几年重用父亲的老臣子，野心不小，如今乘胜而进，解散他的部下改设郡县不是什么难事，只是伊犁一带地广人稀，为收一个小部落要动用太多的人马粮草，感觉有点不上算，所以划了阿尔泰山以西至伊犁这片土地，为策妄阿喇布坦游牧之地。
二十年的功夫，策妄阿喇布坦终于走上了他叔叔的老路，休养生息日渐强盛，于是先则骚扰近地，逐渐犯境，有了公然反对朝廷的迹象了。
策妄阿喇布坦垂涎西藏久矣，尤其是拉萨！西藏在清朝的时候分为四部，康、前藏、后藏、阿里。其中康早就改土归流，称为西藏，前藏在西藏的东部；后藏在中央；西面就是阿里。
拉萨是前藏的首邑，也是西藏最好的一个地方。号称是极乐世界。没有到过这里的，怎么也不能相信，在这样塞北之地，竟有不亚于江南的胜地：四山环抱，一水中流，温暖宜人，放眼望去满目青葱，一片良田。到了春夏之交，桃花吐蕊，柳眼舒青！
拉萨本来是达赖喇嘛坐床之地，不过这时候掌握实权的是一个酋长，称号叫拉萨汗，住在布达拉宫里，管着两万多喇嘛。
拉萨汗也算是个英雄人物，不过年纪大了，宏图壮志都消磨在酒杯中，已去死不远，因而启发了策妄阿喇布坦觊觎之心。
他命他手下的一个大将叫策零敦多布的，在康熙五十五年带领六千精兵，徒步过天山南麓，绕行大戈壁，经出美玉的和田，迤逦向东，昼伏夜行了整整一年的时间，才到达西藏边界！
借着又翻过昆仑山，向东南方向走，从腾格里海湖畔突然攻入拉萨。
策零敦多布带人杀入布达拉宫，杀了拉萨汗，俘虏了他的家族，把各大寺庙的宝贝搜刮一空，送到伊犁，达赖和班禅也都被拘禁了。
警报到京，朝廷自然要处理，不过这时候一来皇帝年岁已大，病体侵寻，再也不复二十年前之勇；二来也有心让皇十四子代父完成一场三番亲征，未尽全功的大勋业，便把这件事拖了下来。
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雍正得位的秘闻是清史之中第一大疑案，认为他得位不正是一派有一个很有力的论点就是，康熙五十七年，皇帝以抚远大将军相授，更准胤祯使用正黄旗纛——这种代表天子亲征的仪节——而暗示圣心早有默定，天命已归（这本书是小说，不是正史考究文字，读者不必为此事争论）！
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十四皇子胤祯移兵到西宁，先做整军的准备，然后传谕各部的台吉，会议进兵西藏，并护送第六世达赖喇嘛入藏。
第六世达赖喇嘛有真假两个。原来，五世达赖大权旁落，圆寂之后朝廷竟然不知道，由一个奸人假借达赖的名号执掌政权，十五年后，朝廷诘问，才随便找了个人充数——闹出一场很荒唐的笑话。