火箭队开始了行动，他们抓捕了美洛耶塔，并且借助美洛耶塔的歌声，开启了海底神殿的封印，并且得到了传说中的写形镜。
“快住手，写形镜的力量不是你能操纵的。”小智好不容易挣脱了牢笼，但他来到祭坛前，发现坂木已经将写形镜举起。
“贤侄啊，你就在那里好好看着吧。”坂木露出不善的表情，举着写形镜大喊道：“出来吧，传说的宝可梦们！”
“美洛！”美洛耶塔叫的更加痛苦，坂木手中的写形镜也散发出光芒。
一道光芒冲天而起，原本晴空万里的天气，瞬间开始变得岛云密布，一个黑色的巨大漩涡出现在神殿上空，给人一种沉重的压抑。
紧接着漩涡中心破开三个口子，三道怒吼从里面传的出来。
“土云！”
“卷云！”
“电云！”
“这个声音是”天桐听着这个叫声。
“传说中的宝可梦们，他们已经被召唤出来了。”拉里说道
随着口子变大，三个凶神恶煞，半身是云朵的宝可梦缓缓的降落下来，它们的目光紧紧的盯着坂木手中的写形镜。
“三云神！”小智面色有些苍白的说到，这三个操纵合众环境的传说的宝可梦出现，可以操纵合众地区的所有环境因素。
如果是普通情况的话，小智很容易就能阻止，但是这次可不一样，因为阿尔宙斯曾经告诉过，持有写形镜的人，可以自由控制三神云。
“你们来的好啊，土地云，龙卷云，雷电云啊。”坂木看着眼前的三神云。
“写形镜啊，利用你的力量，照射出三云神本来的真正面目吧！”板木高举写形镜喊道。
随后松手的写形镜并没有掉落下来，而是漂在空中，紧接着写形镜开始旋转上升，飞到了三云神面前，三云神本能的围绕过来，将三个宝可梦的样子照射出来。
三云神发出声惊天咆哮，三云神被白色的光芒包裹，仿佛要进化一样，紧接着三云神的样子开始发生改变，雷电云变成了大岩蛇一样的身躯，龙卷云化成大鸟，而土地云则是猛虎形态。
三云神眼睛开始变得通红，及时它们本能的抗拒，依旧无法改变它们即将想要释放最原始的野性。
这个时候，希罗娜他们终于赶到了，很快几人就走上了神殿，与小智汇合了。
“小智，你没事吧？”
“我没事，现在必须将美洛耶塔救出来才行。”
“听好了，你们都是我的奴仆，现在就让狂风，雷电和大地的力量颤动吧。”坂木手一挥，三神云使出了各自的力量。
四周的环境发生了变化。天空中闪烁着雷电，大雨和飓风来临，同时整个海面都结冰了。
“现在三神云被应该是被坂木控制了，我们必须阻止他们。”
小智看着坂木用镜子控制着三神云。
“要想阻止三神云，我们就必须将美洛耶塔救出来。”
“要救美洛耶塔，必须拖住三神云才行。”
“那好，小智，你们就去救美洛耶塔吧，三神云交给我。”
“上吧，烈咬陆鲨。”
希罗娜直接派出了自己的王牌烈咬陆鲨。
“我们也要帮忙。去吧！快龙。”
艾莉丝将自己的快龙派了出来。艾莉丝的快龙也是一只十分强的宝可梦。
“快龙拜托你了。”
“我们也上吧，泥偶巨人。”
三只宝可梦朝着三神云冲过去，准备拖住三神云的战斗。
“火神蛾，也拜托你去了。”山里那派出了火神蛾，毕竟火神蛾也算是传说中的宝可梦
“花椰猴，拜托你了。”天桐派出去的是他最优秀的花椰猴
“喷火龙，你也一起上吧。”小智特地的把喷火龙带在身上，就是为了可能预防这一点。
六只宝可梦朝着三神云飞过去，开始和它们进行战斗。