刘孔昭忙着收集和修理战舰，而郑芝龙此时也忙着接受揆一的投降。福建总兵官兼台湾府知府郑芝龙骑着枣红大马，身着五彩洒线揉头猩红麒麟补服，头戴玄色镶玉云纹乌纱帽，腰缠着白玉带，穿着白底黑靴，在俱是甲胄在身，火铳横持的郑家官兵护卫下朝一脸落寞的荷兰长官揆一走来。揆一捧着册子与印章，还有自己的指挥刀，躬身站立在台后。而在他身后的其他荷兰殖民者也尽皆如此，等着明廷官员郑芝龙接受自己的投降。郑芝龙接受了揆一的投降，并当场宣读了大明皇帝陛下朱由检的圣旨。圣旨大意是决定改东番岛为台湾，立为台湾府，改热兰遮城为安平城，以安平城为府治，台湾府以后隶属于福建布政司，而揆一等战俘以及荷兰战船与设备、工匠等全部押送进京等候处理。揆一此时也只能接受这样的命运，被大明郑氏集团的官兵全部用麻绳捆绑住双手，全部拉拽向港口，准备装船起运进京。华人华商百姓见此争着随手拾起石块泥土等往这些荷兰殖民者身招呼，怒骂着，甚至直接过来狂揍着。昔日作威作福的荷兰殖民者此时也只能承受着华人华商的责骂与殴打，而不敢再有任何怨言。至此，在崇祯二十年四月，被荷兰殖民者占据的台湾岛正式回到大明手，且正式接受汉人政权的统治。虽说现在还只能由郑氏集团控制，但名义的行政还是属于大明的领地，可以理解为现在是大明的一土知府。郑芝龙很早开始在台湾府进行开发，如今重新得到台湾府后自然也能驾轻熟地进行开拓，且加佛郎机与荷兰等殖民者的建设，如今郑芝龙重新建立东番岛的政治秩序与生产秩序倒也难度不大。不到两个月，郑芝龙便已将台湾府的各级官吏任命名单全部拟写完毕呈送进京由内阁和司礼监批准。同时，他则开始移居大量汉人来此地安家，且也给自己的部下正式分发土地，并奏朝廷流放犯人可首选台湾之地，这里亟需垦荒等等原因。刘孔昭对于郑芝龙在台湾建立自己的生产基地没有兴趣，他也知道即便陛下不同意郑芝龙收复台湾府，以郑芝龙的实力也能收复台湾府，因而他也对郑芝龙占据台湾府的事不好说什么。“爵爷，这是您的两千顷良田，一千顷是前日劳您诓骗范德兰的酬谢之礼，这一千顷是下官无偿送给您的，只希望以后朝堂关于我郑家的事，还请您多多美言几句，也请您转告陛下，微臣定会替大明守好南疆，不要让一个海盗进入内地州府肆虐，若有，微臣甘愿戮！”郑芝龙将地契给了刘孔昭，现在的他在拥有台湾府后，最不缺的是地，因而给刘孔昭送起礼来也是丝毫不吝啬。刘孔昭乃大元帅府海军部总长，名义是他的官，而且还有一个诚意伯的爵位。郑芝龙也知道陛下朱由检派刘孔昭来这里未尝没有来当监军监视自己的意思，如今的他为了能够取得朱由检的信任，希冀着能得到朝廷的军饷与军械支持，他也自然要向刘孔昭示好。“好说，好说”，刘孔昭也没有拒绝，接过了地契，他也知道自己现在还不是和郑家人对着干的时候，毕竟连陛下都还没有和郑家人对着干。闲话少叙。刘孔昭带着四艘荷兰造的风帆战舰，押送着揆一等荷兰战俘以及大批揆一在占据台湾期间添置的设备以及大批工匠于四月十五日这天正式离开了台湾府，过鸡笼而北，准备返回南京。总体而言，刘孔昭对于自己这趟南疆之行还是很满意的。虽说他重新认识到了郑氏集团的实力，也知道了大明海军还存在多么大的差距，但此刻能为大明海军增加四艘风帆战舰，他已感到很是高兴。“褚怀生，我们从范德兰手里买来这什么一级风帆战舰，貌似还没试过效果吧，本爵想着是不是得找个机会放他几炮，看看效果，若果然不好使，趁着还没给全款，后悔也还来得及。”刘孔昭这么一说，褚怀生也表示赞同：“爵爷，您说得对，还是得放几炮试试。”“在哪里放好呢，你推荐个地方”。刘孔昭这么一说，褚怀生也思索了起来：“在大明船政局读书的时候，陛下说过，这东洋南洋北洋都是我大明的海域，我们是大明的海军，爵爷您又是我们的海军总长，还不是想在哪里放哪里放，不过这一带我们的渔船较多，还是不要扰民的好，也省的朝那些大臣找我们麻烦，依学生看，不如去干脆开去东洋放他几炮，郑先生授课的时候讲过世宗皇帝时的倭乱，这些家伙害死了我们不少人，我们不妨去吓吓这群倭奴。”“嗯，是个好主意，看样子你小子在大明船政局那些日子没白读书”。刘孔昭点了点头便下令整个战船编队全部转向往琉球方向而去，一过琉球，刘孔昭的船队便到达了长崎。“固执约翰”号一级风帆战舰也正式朝这长崎港口逼来，并开始点火放炮，很快整个日本长崎便被连续轰击了三次，每一次都是数十门巨型火炮齐发，整个长崎沿岸堡垒与船只以及房屋被摧毁无数。日本德川幕府闻此消息后十分惊讶，在一想到之前便已有大明的战船出没在长门，便意识到这是天朝国在表达自己的愤怒。德川幕府不敢因此招惹大明，忙准备派使者朝贡大明，向大明皇帝表达自己的善意，希冀大明不要再向日本发泄自己的愤怒。当然，这些都是后话。刘孔昭也没想到自己不过是在日本长崎放了几炮而已，让日本德川幕府吓成这样，在发现自己买下的“固执约翰”号战舰性能完好后便已扬长而去。刘孔昭带回“固执约翰”号一级战舰出现在松江府后倒也引起了整个松江府国人的惊讶。谁也没想到可以有如此大型的战舰，不但如此，等到刘孔昭把战舰带到南京时，也直接惊动了工部的宋应星。
