派去与杜琛谈判的使者们回到了广州府，唯独利类思留在了濠镜澳。官员们向皇帝汇报了情况，一致认为杜琛不会赔礼道歉，更不会补缴地租，只能用武力征服。
李存明道：“尔等辛苦了，任务完成的不错。朕从一开始就没有幻想杜琛能够屈服，这些西洋人本质上就是强盗，朕能耐着性子派使者去见强盗，已经给足了面子。”
继而又问道：“利类思怎么没有回来？”
一个官员答道：“会士利类思在码头给我们送行时，他说留在岛上继续劝说杜琛，尽可能缓解双方的矛盾。臣估摸着利类思多半胳膊肘往外拐，帮助葡萄牙人，非我族类，其心必异。”
“随他去吧！”李存明摆摆手，示意官员们自去休息。
命人叫来巩永固和宋应昇，下旨道：“巩爱卿，你先带领三万兵马去珠海，征集渔船，等施琅指挥水师登上濠镜澳之后，用渔船把士兵们运送过去，从北边压迫葡萄牙守军，协助水师将士们作战。”
“遵旨！”巩永固领命而去。
李存明看向宋应昇，道：“朕随后也要去往珠海，坐镇前线。宋知府除了供应粮草之外，还有一桩重要任务交给你。朕还在浙江余姚的时候，为了安排沿海百姓，下旨开办纺织厂。广东办得如何了？“
“启禀陛下，臣收到曹厂督的公函之后，会同曹厂督派来的人员，在东莞县建了一座厂子，已经投入生产了。”宋应昇答道。
“好，非常好。下令东莞的纺织厂，急调五千匹布送到珠海军营中来，能做到吗？”
宋应昇有些为难道：“纺织厂刚建成不久，调用五千匹布有些困难，三千匹或许还是有的。”
李存明想了想：“罢了，就调三千匹布吧。不过朕还有一个要求，这些布匹必须是上等优质布料，必须是我大明朝最好的布匹，明白吗？”
“臣明白！”宋应昇也领旨而去。
李存明起身伸了个懒腰，活动着筋骨，吩咐夏完淳道：“告诉傻大柱，朕三天后启程去往珠海，让他做好准备。”
夏完淳道：“陛下，兵贵神速，三天后再启程，会不会晚了些？”
“攻打濠镜澳，那是施琅的事情，朕瞧热闹即可。等施琅狠狠地打了杜琛的巴掌，朕才好出面。”李存明哈哈大笑。
……
却说施琅马不停蹄回到新安县，赶往水师大营。他见到黄得功之后，详细转述了皇帝的话语，问道：“靖国公，陛下命令我们攻打濠镜澳，您有何良策？”
黄得功道：“陛下深谋远虑，俺老黄从来十分佩服。陛下一声令下，咱们便赴汤蹈火就是了。不过在商量进攻战术之前，有一件事情必须说清楚了，此次出战是施将军担任指挥官，俺老黄打下手。”
施琅慌忙道：“不可，靖国公威望卓著，我岂敢对你发号施令？指挥官一职，还得由您来担任！”
“施将军啊，你这么说，就是不了解咱们的陛下，也小瞧了俺老黄啦。首先，陛下召你去广州府，面授机宜，已然表明了陛下的用意；其次，俺老黄虽然是个粗人，但也有自知之明。说句大话，在陆地上作战，这军中主将我当仁不让，可到了海里嘛，我就不如你了。”
黄得功说着，拉住施琅的手臂让他坐下去，郑重其事鞠躬拱手，坦坦荡荡道：“末将黄得功，愿听施将军号令，绝无半点怨言！”
施琅好生感动，无比感慨，暗想：“都说黄得功是个桀骜不驯之人，看他的样子，已然被皇上驯服了。好啊，君主贤明，大臣无私，三军将士们用命卖力，大明王朝必将战无不胜攻无不克！”
一念至此，施琅慌忙起身，也行了礼，笑道：“靖国公公忠体国，我施琅再惺惺作态，未免显得矫揉造作。好，我来担任指挥官。”
两人相视而笑，笑过之后，投入紧张的备战工作中去。
施琅先是凭着记忆，拿来一张地图，画出了濠镜澳的防御工事。
他说道：“自从荷兰人攻打濠镜澳之后，葡萄牙人在岛上的经营更加完善起来，咱们先看岛上火力的布置。”
“濠镜澳南部有一座圣佛朗西斯炮台，东岸则构筑了壕沟工事，这是外围的火力部署。而在内陆城中，有一座大炮台，它便是濠镜澳防御体系的中枢。这座炮台专门建立在岛屿的中心位置，用于应付任何突破海岸防御的敌人，尤其是那些从东面登陆的偷袭者。另外还有一座东望山炮台，乃是最重要的制高点。”