澳门其实并没有真正的军队，以往印度果阿总督府，每年会派一支商船队过来，武装商船队有个司令，他到了澳门后，会在澳门呆上几个月时间，等次年季风起再返航，这段时间也是贸易时间，他在澳门的这段时间，便成为澳门的最高军政首领，他船上的兵自然也成了澳门的武装力量。
不过因为澳门议会跟这个司令经常闹冲突，所以近些年才正式派总督前来常任，这总督来了后也开始夺取行政大权，甚至组建了一支佣兵队伍，甚至在发生战斗时，葡萄牙人也都有义务出战协守。
现在明军上去后，直接没收武器，赶走总督，重新编户齐民。
给他们发居住许可证，一年一审核，若有违反在华居住规定，就取消资格，不再续发，要驱逐出境。
他们仍可继续居住现在的房屋，但没有产权，以后得向大明交租。经营的商铺等，也可以继续租赁经营，但需要按时交纳工商税赋、厘金等。
原来的海关，也被大明广州市舶司接管，不再是包税，而是按律征收。
岛上的葡萄牙人不满千，其实翻不起什么浪来。
他们以前靠殖民模式，蓄有上万的非洲、南洋奴隶，也有跟大明、日本、南洋等居民生的混血几百人。
又雇佣了几万明人在他们的炮厂、船厂等工作。
之前朱以海刚起兵时，给澳门的炮厂很多订单，让这个炮厂生意兴隆，规模不断扩大，在广东招募了许多华工。
现在按朱以海的要求，卜加劳铸炮厂改制，朱以海的皇家少府监占三成股，大明工部占四成股，原卜加劳葡萄牙人占三成股。
改制后，股份制经营，成立新的董事会、监事会等，各占董事席位，并组建了全新的经营管理层，这样改制后，铸炮厂得以保存，甚至获得更多订单，收益也更高。
葡萄牙人虽然让出了七成的股份，但若是他们不合作，这个炮厂就会失去大明的订单，以他们现在的处境，根本维系不下去。
澳门的船厂、铳厂等基本上也都是进行了这样的改制。
完成改制后，葡萄牙人在澳门的那些工作基本没丢，就是以后不能再享受国中之国般的自治待遇，但起码还可以继续在澳门生活下去，甚至有技术的在那些厂里，待遇依然挺高。
经商开铺子的，也同样能够继续经营。
损失也是有的，土地、房屋、商铺，甚至城堡、教堂、港口码头、炮台都收归朝廷，连他们的奴隶都被收走了。
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