上官婉儿道：“欲加之罪何患无辞，来俊臣、索元礼最擅于罗织罪名，丘神绩本就死有余辜，他日只要陛下一句话，来、索二人便会给他扣上千百条该死的罪名，陛下又何须为此担心呢？”
武则天道：“没错，自古帝王都是狡兔死，走狗烹，飞鸟尽，良弓藏，他日若是用不着他们的时候，不管是丘神绩，还是来、索，要想杀他们，还不是一句话的事么？既然如此，那就依你说的办，先分化他的亲信党羽，然后安插眼线监视于他。这样他的一举一动，都在哀家的掌握之中，就不怕他再闹出什么事来。”
武则天既已对丘神绩心生怀疑，于是便按照与上官婉儿商量的行事，才几日光景，便将丘神绩所统领的禁军中许多将领分调入来、索的部下，侯思止则被调去守城门，原先的空缺，则从来、索的部下中挑选出官职比较低的将领担任，他们感念武则天的提拔之恩，自是一切听从她的吩咐。
丘神绩本想见到武则天之后，向她提及派兵镇压江湖势力的事，他会重新获得武则天的重用，没想到却是这样的结果，于是他对于重新得势，更加心灰意冷，暗自谋划着反出朝廷，趁江湖纷乱之际，在江湖中另立一门派，到时候只要他一声号令，侯思止乃至原先的部将都会带人归附于他，只要在江湖中有了自己的势力，那么无论是朝廷，还是玄阴教，要想对付他，便没那么容易了。
然而，事有凑巧，他本想玄阴教被自己拒绝之后，不会再派人来请他出兵，没想到他们依然派人来，丘神绩本想避而不见，没想到那些玄阴教中人，竟然趁夜径直去皇宫之中找他，丘神绩也就不得不见。
那几名训练有素的玄阴教弟子，与丘神绩在皇宫中会面，他们听从鄢云的吩咐，对丘神绩讲了那番话之后，便自行离开，丘神绩还在犹豫之中，然而他与玄阴教中人在宫中会面一事，很快便传到武则天的耳中，武则天得知这个消息，颇为震惊。
于是立即召见丘神绩，丘神绩自知死罪难逃，见了武则天，立即跪下，问道：“不知陛下深夜传召微臣，所为何事？”
武则天怒道：“丘神绩，你知罪么？”
丘神绩心想，定是来俊臣、索元礼他们的人告的密，现在只好抵死不认，或许可以活命。于是立即召见丘神绩，丘神绩自知死罪难逃，见了武则天，立即跪下，问道：“不知陛下深夜传召微臣，所为何事？”
于是便答道：“微臣不经陛下允许，私自建造密室，豢养毒物练功，造成宫中毒物为患，虽已平息，但微臣还是死罪难逃，还请陛下允许微臣戴罪立功，微臣一定会将陛下交代微臣做的事办妥。”虽然只有寥寥数语，但丘神绩却将事情撇的一干二净，佯装不知的同时，又自承以往之罪，并且提醒武则天，她曾经允许过自己戴罪立功。
武则天闻言，果然没有提及适才他与玄阴教中人私会之事，于是便说道：“哀家已经交代你的事，你办得怎么样了？哀家听说，你终日待在宫中，并不作为，是将哀家的话，当作耳旁风是么？”
丘神绩道：“陛下明察，微臣虽然待在宫中，但并没有不作为，只因被告周兴是在禁军之中为官，原告又与来俊臣、索元礼脱不了干系，所以微臣这些天来无时不刻不在暗中查探究竟是何人告的密，所告又是否属实？”
武则天道：“那你查出些眉目了么？”