武器装备发明生产之时，吴明也不忘记，改进这个时候的行政体系。
如今天下分为十三州，每一州的最高长官是州牧，或是刺史。
不过这个州牧可比刺史的权利大，州牧拥有一个州最高军事行政权力，而刺史仅仅只是只有监督考察权，实际权力还不如一个郡的太守。
东汉时期，一个太守的年薪俸禄是两千石，但一个刺史的年薪俸禄仅仅只有六百石，由此也可以看见，刺史的实权远远不如太守。
这个州牧吴明肯定不会设置，一人掌管一个州的行政和军事，与独立的小王国有什么差异？
吴明打算平常时期每个州都设刺史、督察、督军三职，形成三权分立，互相制衡，统一对中央负责。
其中刺史主管一州的行政权力；督察主管监察与刑罚；督军主管一州的军事。
而中央机构，吴明则创立元帅府、御史台、尚书省三个机构。
元帅府主管全国军事征伐、军事机密、边地防务、各军军队，最高长官设为大元帅和副大元帅两职。
御史台主管中央行政监察，也分管中央司法审查，负责纠察、弹劾官员、肃正纲纪，最高长官设为御史中丞，副职设为监察御史。
尚书省主管全国的行政，主要负责国家中央行政，最高长官设为左丞相和右丞相并立，不分正副职。
尚书省下面还设有六个部门，即六部：吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部，每部最高长官，正职设为尚书，副职设为侍郎。
吏部，掌管全国官吏的任免、考课、升降、调动等事务。
户部，掌全国疆土、田地、户籍、赋税、俸饷及一切财政事宜。
礼部，考吉、嘉、军、宾、凶五礼之用，管理全国学校事务及科举考试及藩属和外国之往来事。
兵部，掌管选用武官及兵籍、军械、军令等军政事务。
刑部，主管全国各地刑罚政令及审核刑名。
工部，掌管各项工程、工匠、屯田、水利，并负责各种机械的研制发明生产。
其中，左丞相负责政令的起草，右丞相负责审核，然后共同商议，交与到六部去执行。
当众文武看着吴明这一条又一条的制度改革，又惊又喜，不禁纷纷竖起大拇指，称赞不断。
“主公，这一州设三个主官，刺史、督察、督军，分掌行政、监察、军事，三权分立，这样一来可以有效的避免地方权力过大，而出现诸侯割据的局面，实在是妙啊。”赵云看完之后，第一个击掌叫好。