2月28日蒋介石飞抵西安，与胡宗南部署进攻延安事宜，所以“二二八”事件就被暂时搁置起来，没有汇报给他。
3月1日行政院院长宋子文因2月的黄金风潮被弹劾而辞职，院长由蒋介石兼任。
3月2日，台北市民众成立“二二八事件处理委员会”，并随后在各地成立分会，代表民众就事件处理和台湾的政治改革与行政长官公署交涉。
陈仪也派人参加了这个委员会。同时急电南京:“台湾发生暴乱，已及全省，形势危急，请速派国军赴台救援。”
蒋介石接报，经与国民党要员商量，均认定“二二八起义”是“暴乱”，为防止事态扩大，必须采取果断措施，进行镇压。蒋介石立即电令驻守上海的21军火速乘船赶赴台湾增援，并限令于8日前赶到。在国民党国防部长白崇禧率领下赴台湾镇压。
47年3月8日，委员会通过其宣传部长王添丁起草的“三十二条要求”，包括实行地方自治、保障人民基本权益、废除**制度、减免苛捐杂税等条款，基本反映了台湾各界人士要求民主和自治的合理愿望。
但是，随着起义规模的不断扩大，起义队伍中也混进了一些不良分子，包括与日本关系密切的地方绅士和流氓，他们将三十二条扩大为四十二条，增加了一些不切实际甚至错误的主张，例如要求接管行政长官公署等，致使陈仪怒而撤出了派往委员会的代表，并加紧部署镇压行动。
8日中午，21军先头部队在基隆登陆。遭到起义群众阻拦后，21军竟在船上架起机枪向码头上的群众扫射。
9日，国民党主力部队在血洗基隆后，进驻台北，与驻守在台湾南部地区的国民党“高雄要塞司令”彭孟缉联手，对起义群众进行大规模镇压。
经过近半个月的艰苦斗争，“二二八起义”最终失败。大批台湾市民、学生及社会知名人士包括教授、作家、医生遭到屠杀，确凿死亡人数难以计算，此外，还有不少人被捕、逃亡和失踪。“二二八事件处理委员会”也被当作非法组织遭取缔。
3月，国民党还在台湾进行了大规模地收缴枪支和肃清“暴乱”分子活动。4月24日，国民党**撤消台湾行政长官公署，成立台湾省**，陈仪被撤职赋闲，魏道明被任命为台湾省**主席。
“二二八”事件中牺牲受难者的详细明确数目因为国民**的漠视，一直都有所争议。
行政院官方调查报告是死1万8000人至2万8000人。事实上由于种种原因，例如当时**所主导的滥杀行动，很多没有书面资料遗留，各界对“二二八”事件确实的牺牲者人数，一直有极不一致的估算。
从不到一千人，一直到十几万人不等。白崇禧报告书 死伤1860人。《纽约时报》霍伯曼南京专电 死2200人。台湾警备总司令部死3200人。保安司令部 死6300人。监察委员何汉文至少死7000至8000人。《纽约时报》记者杜尔曼?德丁专电 死1万人。台湾旅沪六团体1947年《台湾事件报告书》 死1万人以上。民政厅长蒋渭川1947年《二二八事件报告书》 死1万7000人至1万8000人。日本《朝日新闻》调查研究室 死1万至数万人。美国驻台领事馆副领事乔治柯尔死2万多人···